个人简介 |
计智伟,教授,博士生导师,于2020年8月以海外高层次引进人才加盟澳门葡萄新京网站(中国)有限公司。数据科学与智能计算研究中心(Center for Data Science and Intelligent Computing)负责人。智能科学与技术博士点学术带头人。数据科学与大数据技术本科专业负责人。回国之前,计博士受聘于美国德克萨斯大学(The University of Texas),生物医学信息学系(SBMI),助理教授。 计博士于2016年在同济大学计算机系取得“模式识别与智能系统”专业的博士学位。从2013年5月起,在美国维克森林大学和德克萨斯大学从事科研工作,先后任研究员,博士后,助理教授。研究兴趣包括:大数据智能计算,人工智能与模式识别,生物信息与系统生物学。近五年,在相关领域重要期刊,包括:Briefings in Bioinformatics (2023), Cell Death & Disease (2022), PLoS Computational Biology (2019), Computers in Biology and Medicine (2021), Transboundary and Emerging Diseases (2021), IEEE Transactions on Industrial Informatics (2021), IEEE Transactions on Systems, Man, and Cybernetics: Systems (2019), Expert Systems with Applications (2022), Knowledge-based Systems (2021), Information Sciences (2019), IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (2022, 2021, 2020), Plant Phenomics (2023),发表SCI论文50多篇,谷歌他引2100多次,H指数27。共有7篇论文进入全球引用前1%。单篇他引超过100次的论文有8篇。申请中国发明专利4项:已授权1项 (2019)、实质审查公开2项 (2022,2023)。计博士的研究成果受到了领域学者的广泛关注,多个算法模型已被写入Springer和Elsevier经典教材并分别于2019和2020年在全球公开发行。受邀担任TII, TKDE, TSMC, BIB, ESWA, KBS, CVPR, ICDM和BIBM等知名期刊和会议的同行评审专家。作为Guest Editor,分别在TCBB, Frontiers系列杂志上成功举办了6个Special Issue,出版Ebook一部。 ˜ 工作经历 Ø 2019.3-2020.7,美国德克萨斯大学,休斯顿健康科学中心UTHealth,生物医学信息学系(SBMI),助理教授。 Ø 2017.7-2019.2,美国德克萨斯大学,休斯顿健康科学中心UTHealth,生物医学信息学系(SBMI),博士后。合作导师:Prof. Xiaobo Zhou(AIMBE Fellow) Ø 2016.9-2017.6,美国维克森林大学,放射系,生物信息与系统生物学研究中心,博士后。合作导师:Prof. Xiaobo Zhou。 Ø 2013.5-2015.6,美国维克森林大学,放射系,生物信息与系统生物学研究中心,研究员。 Ø 2003.7-2011.6,浙江农林大学,信息工程学院,讲师。 ˜ 教育经历 Ø 2011.9-2016.3,同济大学,计算机系,模式识别与智能系统,工学博士。导师:黄德双教授(IEEE Fellow, IAPR Fellow, AAIA Fellow) Ø 2006.9-2009.3, 上海大学,计算机工程与科学学院,计算机应用技术,工学硕士。导师:吴耿锋教授 Ø 2005.2-2006.1,浙江大学,计算机科学与技术学院,访问学者。 Ø 1999.9-2003.6,浙江农林大学,信息工程学院,计算机科学与技术,工学学士。 ˜ 学术荣誉或学术兼职 Ø 中国生物信息学会-多组学与整合生物学专委会委员,2022.05--现在 Ø 中国-拉丁美洲农业教育科技创新联盟专家,2022.03--现在 Ø 科技部 国家科技专家库评审专家,2021.06--现在 Ø 南京农业大学澳门葡萄新京网站学术委员会委员,2020.09--现在 Ø 江苏省生物信息学专业委员会委员,2020.11--现在 Ø 江苏省教育厅本科专业综合评估专家,2021.09--现在 |
学术成果 (论文、专利、软著等) |
一、主要代表作 (平均IF为:7.265,参考Letpub五年影响因子) 1. S Xie, X Xie, X Zhao, F Liu, Y Wang, J Ping, Z Ji*. HNSPPI: A Hybrid Computational Model Combing Network and Sequence Information for Predicting Protein-Protein Interaction. Briefings in Bioinformatics, 2023. (CCF推荐期刊, JCR Q1, IF=10.6) 2. X Xie, F Xia, Y Wu, S Liu, K Yan, H Xu, Z Ji*. A novel Feature Selection Strategy Based on Enhanced Slap Swarm Algorithm for Diseased Plant Classification. Plant Phenomics, 2023. (Science Partner Journal, JCR Q1, IF=7.5) 3. Z Ji#, J Mims#, N Devarie-Baez, J Lewis, H Wu, K Shukla, E Lopez, V Vitvitsky, C Key, M Kemp, R Banerjee, J Parks, A Tsang, X Zhou*, C Furdui*. Redox Integration of Signaling and Metabolism in a Head and Neck Cancer Model of Radiation Resistance using COSMRO. Frontiers in Oncology, 2023. (JCR Q2, IF=5.2) 4. E Kim, Y Kim, Z Ji, J Kang, K Ono, M Wirianto, K Paudel, J Kim, K Mahan, X Zhou, H Lee, J Yoo, S Yoo, Z Chen. ROR activation by Nobiletin enhances anti-tumor efficacy via suppression of IκB/NF-κB signaling in triple-negative breast cancer. Cell Death & Disease, 2022. (Cell Press重要期刊, JCR Q1, IF=9.2) 5. Z Ji*, K Yan, X Xie, Y Xiang, J Huang. A Space-embedding Strategy for Anomaly Detection in Multivariate Time Series. Expert Systems with Applications, 2022, 206: 1-15. (CCF推荐期刊, JCR Q1, IF=8.5) 6. K Yan, X Guo, Z Ji, X Zhou. Deep Transfer Learning for Cross-Species Plant Disease Diagnosis Adapting Mixed Subdomains. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2021. (CCF推荐期刊, JCR Q2, IF=4.5) 7. F Xia#, X Xie#, S Jin, K Yan, Z Ji*. A Novel Computational Framework for Precision Diagnosis and Subtype Discovery of Plant with Lesion. Frontiers in Plant Science, 2021. (JCR Q1, IF=6.8) 8. X Xie, X Gu, Y Li, Z Ji*. K-size partial reduct: positive region optimization for attribute reduction. Knowledge-based Systems, 2021, 228: 1-16. (CCF推荐期刊, JCR Q1, IF=8.8) 9. X Zhao, H Li, S Lyu, J Zhai, Z Ji, et al., Single-cell transcriptomics reveals heterogeneous progression and EGFR activation in pancreatic adenosquamous carcinoma. International Journal of Biological Sciences, 2021, 17: 2590-2605. (JCR Q1, IF =9.2) 10. Z Ji*, C Liu, W Zhao, C Soto, X Zhou*. Multi-scale modeling for systematically understanding the key roles of microglia in AD development. Computers in Biology and Medicine, 2021, 133: 1-10. (JCR Q1, IF=7.7) 11. T Sun, Y Guo, L Zhao, M Fan, N Huang, M Tian, Q Liu, J Huang, Z Liu, Y Zhao, Z Ji, J Ping*. Evolution of the PB1 gene of human influenza A(H3N2) viruses circulating between 1968 and 2019. Transboundary and Emerging Diseases, 2021. (JCR Q1, IF=4.3) 12. N Jin, Y Zeng, K Yan, Z Ji. Multivariate Air Quality Forecasting with Nested LSTM Neural Network, IEEE Transactions on Industrial Informatics, 2021. (CAA推荐期刊, JCR Q1, IF=12.3) 13. H Hu, Q Guan, S Chen*, Z Ji*, Y Lin. Detection and Recognition for Life State of Cell Cancer Using Two-Stage Cascade CNNs. IEEE/ACM Transaction on Computational Biology and Bioinformatics, 2020, 17(3): 887-898. (CCF推荐期刊, JCR Q2, IF=4.5) 14. W Wang, Y Zhou, M Cheng, Y Wang, C Zheng, Y Xiong, P Chen, Z Ji*, B Wang*. Potential Pathogenic Genes Prioritization Based on Protein Domain Interaction Network Analysis. IEEE/ACM Transaction on Computational Biology and Bioinformatics, 2020, 18(3): 1026-1034. (CCF推荐期刊, JCR Q2, IF=4.5) 15. K Yan, J Huang, W Shen, Z Ji*. Unsupervised learning for fault detection and diagnosis of air handling units, Energy and Buildings, 2020, 20: 109689. (JCR Q1, IF=6.7) 16. Z Ji#, W Zhao#, HK Lin, X Zhou*. Systematically understanding the immunity leading to CRPC progression. PLoS Computational Biology, 2019, 15 (9): e1007344. (CCF推荐期刊, JCR Q1, IF=5.4) 17. M Hu, X Feng, Z Ji*, K Yan*, S Zhou. A novel computational approach for discord search with local recurrence rates in multivariate time series. Information Sciences, 2019, 477: 220-233. (CCF推荐期刊, JCR Q1, IF=8.1) 18. K Yan#, Z Ji#, H Lu*, J Huang, W Shen, Y Xue. Fast and accurate classification of time series data using extended ELM: Application in fault diagnosis of air handling units. IEEE Transactions on Systems, Man, and Cybernetics: Systems, 2019, 49 (7): 1349-1356. (CAA推荐期刊, JCR Q1, IF=9.5, ESI高被引) 19. K Yan, Z Ji*, W Shen. Online fault detection methods for chillers combining extended kalman filter and recursive one-class SVM. Neurocomputing, 2017, 228: 205-212. (CCF推荐期刊, JCR Q1, IF=6) 20. Z Ji, B Wang, S Deng, Z You. Predicting dynamic deformation of retaining structure by LSSVR-based time series method. Neurocomputing, 2014, 137: 165-172. (CCF推荐期刊, JCR Q1, IF=6) 二、发明专利 1. 时磊,刘君强,计智伟,一种能量有效的混合无线传感器网络路由方法, 中国发明专利,ZL 201710050189.9, 2019-09-06。 2. 计智伟,夏菲,一种基于群智能优化的植物病害高精度识别方法,中国发明专利,实质审查公开,2022。 3. 计智伟,王宗钦,一种基于人工智能的细胞类型高精度识别方法,中国发明专利,实质审查公开,2023。 4.计智伟,池路通,一种人工智能驱动的蛋白-蛋白相互作用预测模型,中国发明专利,已提交申请,2023。 三、软件著作权 1. 夏菲, 计智伟,植物病害智能识别系统V1.0,计算机软件著作权登记,2022。 2. 王宗钦,计智伟,一种scRNA-seq数据快速聚类分析工具V1.0,计算机软件著作权登记,2023。 四、成果相关教材 1. 提出的BLP模型被写入了Springer教材Methods in Molecular Biology丛书之一《Bioinformatics and Drug Discovery》第16章第287页(2019年出版)。 2. 提出有关细胞间通讯的系统模型被写入了Elsevier教材《Exploring Mathematical Modeling in Biology》第2章第54页(2020年出版)。 |